RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557779.1

TMEM229B-208, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-208ENST00000557779 ATP2A1O14983 1001 aa28.68■■■□□ 2.18
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TMEM229B-208ENST00000557779 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
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TMEM229B-208ENST00000557779 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa28.54■■■□□ 2.16
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