RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RAD21	O60216	631 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	ZBED4	O75132	1171 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	COL6A1	P12109	1028 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	PDE4A	P27815	886 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	DPF3	Q92784	378 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	TTC14	Q96N46	770 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CS-223	ENST00000551137		H0YGN5	161 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	NMT2	O60551	498 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CYP2C19	P33261	490 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	KCTD2	Q14681	263 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	FAM160B2	Q86V87	743 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	MMP19	Q99542	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SLC34A2	O95436	690 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SLC1A4	P43007	532 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	STAT2	P52630	851 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SEPT4	O43236	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	MCC	P23508	829 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ZNF213	O14771	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	EVI5	O60447	810 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	HAND2	P61296	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	PFAS	O15067	1338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ZNF536	O15090	1300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	RAD50	Q92878	1312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DNM1L	O00429	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	PGK2	P07205	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ESR2	Q92731	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	CNGA1	P29973	690 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	IL25	Q9H293	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-223	ENST00000551137	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	PDHB	P11177	359 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	CHML	P26374	656 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-223	ENST00000551137	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms