RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 RNF208Q9H0X6 261 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 EHD4Q9H223 541 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 VCPKMTQ9H867 229 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TAF1P21675 1872 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PRR29P0C7W0 189 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CALM1P0DP23 149 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CALM2P0DP24 149 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CALM3P0DP25 149 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLURP2P0DP57 97 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 STAT3P40763 770 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CEP95Q96GE4 821 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 MYPNQ86TC9 1320 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB43O43298 467 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CFBP00751 764 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 HERVK_113P62684 666 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DPF3Q92784 378 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MMP19Q99542 508 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PANK2Q9BZ23 570 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FBXO40Q9UH90 709 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PASKQ96RG2 1323 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 H3BQV1 296 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TBC1D12O60347 775 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CDKL5O76039 1030 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CHGBP05060 677 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MAPK4P31152 587 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 COPB2P35606 906 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RGS2P41220 211 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NEK4P51957 841 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 IFFO2Q5TF58 517 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MCTP1Q6DN14 999 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MB21D1Q8N884 522 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TNKSO95271 1327 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SLC16A2P36021 539 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RTN1Q16799 776 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FEM1BQ9UK73 627 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ADCY3O60266 1144 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD1Q15327 319 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SBK1Q52WX2 424 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TSC1Q92574 1164 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SGSM2O43147 1006 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 KIF4AO95239 1232 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 VCAM1P19320 739 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ATP2B1P20020 1258 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PDE4DQ08499 809 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TLR2O60603 784 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NDUFB10O96000 172 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RXRAP19793 462 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 NAPAP54920 295 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 ATG4CQ96DT6 458 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 WBP1LQ9NX94 342 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-206ENST00000548122 SP4Q02446 784 aa6.32□□□□□ -1.4
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