RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.41■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 COG6Q9Y2V7 657 aa29.41■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa29.41■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 KCNA10Q16322 511 aa29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 CPXCR1Q8N123 301 aa29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 VTI1AQ96AJ9 217 aa29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 RIPK3Q9Y572 518 aa29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.4■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa29.39■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
MACROD1-208ENST00000545464 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.39■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 GRIN2CQ14957 1233 aa29.38■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 TOX2Q96NM4 488 aa29.38■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.38■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.38■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 MOXD2PA6NHM9 499 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 F5H6K3 240 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 DNAJB2P25686 324 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 KLRC3Q07444 240 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.37■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 MYADML2A6NDP7 307 aa29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 ZBED4O75132 1171 aa29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 NDUFB10O96000 172 aa29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 TIMP1P01033 207 aa29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 KLHDC9Q8NEP7 349 aa29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 GLT1D1Q96MS3 346 aa29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.36■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 RASA1P20936 1047 aa29.35■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 KIFC2Q96AC6 838 aa29.35■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 ACVR2BQ13705 512 aa29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF576Q9H609 170 aa29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 NYAP2Q9P242 653 aa29.34■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.33■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.33■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 TIFAQ96CG3 184 aa29.33■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 SPC25Q9HBM1 224 aa29.33■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
MACROD1-208ENST00000545464 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.32■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ASGR1P07306 291 aa29.32■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 TBX21Q9UL17 535 aa29.32■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 MROH7Q68CQ1 1323 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC144BQ3MJ40 725 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 SBK1Q52WX2 424 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 GNASQ5JWF2 1037 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 MFSD5Q6N075 450 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 USP38Q8NB14 1042 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 PPM1EQ8WY54 764 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 PRDM6Q9NQX0 595 aa29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ELP1O95163 1332 aa29.3■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.3■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.285e-10■■□□□ 11.5
MACROD1-208ENST00000545464 CCDC174Q6PII3 467 aa29.3■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ADCY6O43306 1168 aa29.29■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa29.29■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.29■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.29■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 GRXCR1A8MXD5 290 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 PRDM1O75626 825 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 APPP05067 770 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ACRP10323 421 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 CSF2RAP15509 400 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 MIER1Q8N108 512 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM199Q8N511 208 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 MYH7P12883 1935 aa29.28■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ARVCFO00192 962 aa29.27■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 ATP2A1O14983 1001 aa29.27■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 CST5P28325 142 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
MACROD1-208ENST00000545464 PBX2P40425 430 aa29.27■■■□□ 2.28
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