RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544760.1

KDM5A-210, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 2,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-210ENST00000544760 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 SPATA21Q7Z572 469 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 ORAI2Q96SN7 254 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 KRT86O43790 486 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 IMPDH2P12268 514 aa22.08■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 HERVK_113P62684 666 aa22.08■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.08■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 SPATA20Q8TB22 786 aa22.08■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 TSC22D3Q99576 134 aa22.08■■□□□ 1.13
KDM5A-210ENST00000544760 GSTA1P08263 222 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PPP1R7Q15435 360 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CREG2Q8IUH2 290 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 ZFATQ9P243 1243 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 MRC1P22897 1456 aa22.08■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SETSIPP0DME0 302 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 ALADP13716 330 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 KRT9P35527 623 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 VAV2P52735 878 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 QPCTQ16769 361 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 ARMC3Q5W041 872 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CHP1Q99653 195 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 HINFPQ9BQA5 517 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 NDST4Q9H3R1 872 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PDE6BP35913 854 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 KRT83P78385 493 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.07■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 B4DLN1 442 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 E7EWF7 191 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 IDEP14735 1019 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 ATP4AP20648 1035 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CCDC38Q502W7 563 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 JADE2Q9NQC1 790 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PEAK1Q9H792 1746 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CFAP73A6NFT4 308 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 GNAT1P11488 350 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CUL4BQ13620 913 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 KANK3Q6NY19 840 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 EPAS1Q99814 870 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.06■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CDKL5O76039 1030 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PAEPP09466 180 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 FAM163BP0C2L3 166 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CCDC63Q8NA47 563 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SNX12Q9UMY4 172 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 KIF1AQ12756 1690 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PRLRP16471 622 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SLC7A5Q01650 507 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 TEX9Q8N6V9 391 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 FBXO3Q9UK99 471 aa22.05■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 TEFQ10587 303 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 PAK2Q13177 524 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 VPS37DQ86XT2 251 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 AGAP11Q8TF27 550 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 C4AP0C0L4 1744 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 C4BP0C0L5 1744 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.04■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.03■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CDC25AP30304 524 aa22.03■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 CDC25CP30307 473 aa22.03■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.03■■□□□ 1.12
KDM5A-210ENST00000544760 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.6 ms