RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 CREG2Q8IUH2 290 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 MIA2Q96PC5 1412 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 PTPN23Q9H3S7 1636 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 TNFRSF10CO14798 259 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 SRFP11831 508 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 DUSP13Q9UII6 198 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 TM9SF2Q99805 663 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 RNF114Q9Y508 228 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 PREX2Q70Z35 1606 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 FAM168AQ92567 244 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-214ENST00000530727 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 GDNFP39905 211 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 AFMP43652 599 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 TTC6Q86TZ1 520 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 HDAC8Q9BY41 377 aa5.71□□□□□ -1.49
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