RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 RARBP10826 455 aa26.57■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.57■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa26.57■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.57■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa26.56■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 TRIM60Q495X7 471 aa26.56■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 FERMT2Q96AC1 680 aa26.56■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.56■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa26.56■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 PHF24Q9UPV7 400 aa26.56■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 TTLL1O95922 423 aa26.55■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.847e-7■■■■□ 23
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FGFR4-216ENST00000514472 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.55■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 FSD1Q9BTV5 496 aa26.55■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.55■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 MTMR10Q9NXD2 777 aa26.55■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 FEM1BQ9UK73 627 aa26.55■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.55■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 ZBED4O75132 1171 aa26.54■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa26.54■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 PGK1P00558 417 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 AKR1A1P14550 325 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 MX1P20591 662 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 PDE4BQ07343 736 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 RNF180Q86T96 592 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 CPXCR1Q8N123 301 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 KIFC2Q96AC6 838 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 NAPBQ9H115 298 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa26.53■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 FOXP2O15409 715 aa26.52■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 TSPY3P0CV98 308 aa26.52■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 TSPY8P0CW00 308 aa26.52■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 PPARAQ07869 468 aa26.52■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 DDX11Q96FC9 970 aa26.52■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.52■■□□□ 1.84
FGFR4-216ENST00000514472 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 POTEB2H3BUK9 544 aa26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 ADAMTS4O75173 837 aa26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 TFAP4Q01664 338 aa26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 TRIM43BA6NCK2 446 aa26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 BMP3P12645 472 aa26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 OAZ1P54368 228 aa26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 TLE2Q04725 743 aa26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 SLFN13Q68D06 897 aa26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 SLC4A3P48751 1232 aa26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 CHST13Q8NET6 341 aa26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 BADQ92934 168 aa26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 FGD4Q96M96 766 aa26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 CDH23Q9H251 3354 aa26.49■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 A0A1W2PQY0 241 aa26.48■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.48■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 KLHDC9Q8NEP7 349 aa26.48■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 FBXO40Q9UH90 709 aa26.48■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 FAM184BQ9ULE4 1060 aa26.48■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.47■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.47■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 FDX1P10109 184 aa26.47■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 SHHQ15465 462 aa26.47■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 GMCL1Q96IK5 515 aa26.47■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 TMEM232C9JQI7 657 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 ITGB8P26012 769 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 STAT2P52630 851 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 INCENPQ9NQS7 918 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.46■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 EYSQ5T1H1 3165 aa26.45■■□□□ 1.83
FGFR4-216ENST00000514472 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.45■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 ACVR2BQ13705 512 aa26.45■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.45■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.45■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF536O15090 1300 aa26.44■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 PLA2G6O60733 806 aa26.44■■□□□ 1.82
FGFR4-216ENST00000514472 CLTBP09497 229 aa26.44■■□□□ 1.82
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