RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GREM2Q9H772 168 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OGFRQ9NZT2 677 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YEATS4O95619 227 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMTNP53814 917 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FANCCQ00597 558 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 METTL24Q5JXM2 366 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COX20Q5RI15 118 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MICU3Q86XE3 530 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMX1Q9H3N1 280 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DISP2A7MBM2 1401 aa7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FANCGO15287 622 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CMA1P23946 247 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRIN1Q05586 938 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDE4BQ07343 736 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC39A14Q15043 492 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYCP1Q15431 976 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LONRF3Q496Y0 759 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRT40Q6A162 431 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VPS37DQ86XT2 251 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXL16Q8N461 479 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HCSTQ9UBK5 93 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL2RAP01589 272 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCF3P15923 654 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BMP6P22004 513 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GUCY1A2P33402 732 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYKP43405 635 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PHKA1P46020 1223 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NR5A1Q13285 461 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPAQ15257 358 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FEZ1Q99689 392 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TJP1Q07157 1748 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.55□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGA6P23229 1130 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADD2P35612 726 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GSDMDP57764 484 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VPS72Q15906 364 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POTEGQ6S5H5 508 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRAPQ7Z569 592 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP3K14Q99558 947 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EPC1Q9H2F5 836 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATG3Q9NT62 314 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FANCLQ9NW38 375 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMIM22K7EJ46 135 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNFRSF10BO14763 440 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CSF1RP07333 972 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBASH3AP57075 661 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTFR1Q15390 333 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM26DQ5JW98 314 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APOA5Q6Q788 366 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNKSR1Q969H4 720 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.54□□□□□ -1.2
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms