RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PLS1Q14651 629 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TKFCQ3LXA3 575 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 IL27Q8NEV9 243 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG4CQ96DT6 458 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SRRDQ9UH36 339 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MTMR7Q9Y216 660 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MYH4Q9Y623 1939 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF5Q13568 498 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 KCTD1Q719H9 257 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TNS4Q8IZW8 715 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RAET1EQ8TD07 263 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM47Q96LD4 638 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MAF1Q9H063 256 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP2R5BQ15173 497 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 Q3C1V9 767 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR78Q5VTH9 848 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST13Q8NET6 341 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 BTBD7Q9P203 1132 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CNMDO75829 334 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SMARCA1P28370 1054 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RCAN1P53805 252 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR142Q7Z601 462 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SGMS1Q86VZ5 419 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 RASEFQ8IZ41 740 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL16Q8N461 479 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 LY9Q9HBG7 655 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-208ENST00000504294 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 FCER1AP12319 257 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 CAPN2P17655 700 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 RGS2P41220 211 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ANTXR2P58335 489 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 KCTD2Q14681 263 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST3Q7LGC8 479 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 TAF6LQ9Y6J9 622 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 KLRF2D3W0D1 207 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ERCC3P19447 782 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 CASTP20810 708 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPREP23469 700 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 GRM4Q14833 912 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 RUFY3Q7L099 469 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF654Q8IZM8 581 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 CPXCR1Q8N123 301 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ICAM1P05362 532 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS6KB1P23443 525 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 FLT3LGP49771 235 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 UBXN2AP68543 259 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 TROAPQ12815 778 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD1Q15327 319 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ADCK5Q3MIX3 580 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 DPP9Q86TI2 863 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 REPS2Q8NFH8 660 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 GRK4P32298 578 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 PRKCZQ05513 592 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP2K5Q13163 448 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-208ENST00000504294 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms