RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	TOMM22	Q9NS69	142 aa		32.1	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	CNGA1	P29973	690 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	NBPF3	Q9H094	633 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	RIPK3	Q9Y572	518 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	CYBA	P13498	195 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	CPXCR1	Q8N123	301 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	MAML3	Q96JK9	1138 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MIB2-215	ENST00000502470	ZBED4	O75132	1171 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	PGK2	P07205	417 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	COPB2	P35606	906 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	KCTD2	Q14681	263 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	GMCL1	Q96IK5	515 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM232	C9JQI7	657 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	ATP2A1	O14983	1001 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	MCC	P23508	829 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	NOV	P48745	357 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	EVI5	O60447	810 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	SLC4A3	P48751	1232 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	PFAS	O15067	1338 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	HIP1	O00291	1037 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	SLC1A4	P43007	532 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	STAT2	P52630	851 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	TTC22	Q5TAA0	569 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	KCTD1	Q719H9	257 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	MTMR7	Q9Y216	660 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	MCM3AP	O60318	1980 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	MSC	O60682	206 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	SLC34A2	O95436	690 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MIB2-215	ENST00000502470	COL6A1	P12109	1028 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	FAM160B2	Q86V87	743 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		32.01	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	ANO1	Q5XXA6	986 aa		32	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	IL25	Q9H293	177 aa		32	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	PLA2G6	O60733	806 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	OAZ1	P54368	228 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	TINF2	Q9BSI4	451 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	NEDD4	P46934	1319 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF213	O14771	459 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	SEPT4	O43236	478 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	FDX1	P10109	184 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF536	O15090	1300 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	DDX11	Q96FC9	970 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	31.96	■■■□□ 2.71	2e-6	■■■□□ 18.3
MIB2-215	ENST00000502470	CHST13	Q8NET6	341 aa		31.96	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	DCAF4	Q8WV16	495 aa		31.96	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		31.96	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	SNAP25	P60880	206 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC96	Q2M329	555 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MIB2-215	ENST00000502470	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	FBXO40	Q9UH90	709 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC174	Q6PII3	467 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	ESR2	Q92731	530 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		31.93	■■■□□ 2.7
MIB2-215	ENST00000502470	DNM1L	O00429	736 aa		31.92	■■■□□ 2.7

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