RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-207ENST00000498454 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-207ENST00000498454 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-207ENST00000498454 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-207ENST00000498454 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-207ENST00000498454 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-207ENST00000498454 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 LARGE1O95461 756 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ALDH1A1P00352 501 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CDC27P30260 824 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 GNAQP50148 359 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 STK3Q13188 491 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ME3Q16798 604 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 KIFC2Q96AC6 838 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CPVLQ9H3G5 476 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 PFKFB2O60825 505 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 MCM2P49736 904 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 HERVK_113P62684 666 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 PPP2R5BQ15173 497 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ATG4CQ96DT6 458 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CA12O43570 354 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 LBX2Q6XYB7 198 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 NBPF11Q86T75 865 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SCRN1Q12765 414 aa24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CRHR2Q13324 411 aa24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 RNF186Q9NXI6 227 aa24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 VWA5AO00534 786 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CYTH3O43739 400 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 FDX1P10109 184 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SMARCA1P28370 1054 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 NECAB1Q8N987 351 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-207ENST00000498454 MYH6P13533 1939 aa24.57■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 GTF3C6Q969F1 213 aa24.57■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.57■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.57■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 TLR2O60603 784 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ZBED4O75132 1171 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 TRPA1O75762 1119 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 SNAP25P60880 206 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 FUT2Q10981 343 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 ST3GAL1Q11201 340 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 NTRK3Q16288 839 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 MB21D1Q8N884 522 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 REPS2Q8NFH8 660 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 SNX21Q969T3 373 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 TMX3Q96JJ7 454 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CPLX1O14810 134 aa24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CNMDO75829 334 aa24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 MTMR8Q96EF0 704 aa24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 BTBD7Q9P203 1132 aa24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 CPA4Q9UI42 421 aa24.55■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 PEX10O60683 326 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 TBC1D8O95759 1140 aa24.54■■□□□ 1.52
TTYH3-207ENST00000498454 IFNAR1P17181 557 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms