RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497637.5

ACTN4-208, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 877 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-208ENST00000497637 SMIM22K7EJ46 135 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 ZBTB43O43298 467 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 CYP2D6P10635 497 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 RCAN1P53805 252 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 TCP10Q12799 353 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 WTAPQ15007 396 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 PFASO15067 1338 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 CCDC69A6NI79 296 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.271e-6■□□□□ 11.3
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ACTN4-208ENST00000497637 GSE1Q14687 1217 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 SEC23AQ15436 765 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 RGS22Q8NE09 1264 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 NID2Q14112 1375 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN4-208ENST00000497637 COL6A1P12109 1028 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 PDE4BQ07343 736 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 TEX11Q8IYF3 940 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 CPLX1O14810 134 aa22.94■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 GJD2Q9UKL4 321 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.93■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 H3BQV1 296 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.93■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 IQCA1Q86XH1 822 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.92■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.92■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 RESTQ13127 1097 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.91■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 PRDM1O75626 825 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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ACTN4-208ENST00000497637 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 CDC27P30260 824 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 EVX2Q03828 476 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 TRIM32Q13049 653 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.262e-10■■□□□ 13.5
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ACTN4-208ENST00000497637 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTN4-208ENST00000497637 MBD3O95983 291 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 PLA2G5P39877 138 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 NTRK3Q16288 839 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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ACTN4-208ENST00000497637 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 TRIB2Q92519 343 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 FLT1P17948 1338 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 STK36Q9NRP7 1315 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 MAP3K10Q02779 954 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 RTN1Q16799 776 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 FERMT3Q86UX7 667 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN4-208ENST00000497637 ANKS1AQ92625 1134 aa22.88■■□□□ 1.25
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