RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 NECTIN1Q15223 517 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 MROH8Q9H579 483 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 KAT14Q9H8E8 782 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC25A27O95847 323 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDHBP11177 359 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 RGS2P41220 211 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAP2K5Q13163 448 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 PNMA1Q8ND90 353 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLXNB2O15031 1838 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNHG28P0DPA3 235 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRB14Q14449 540 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SEC23AQ15436 765 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP2A1O14983 1001 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 STRNO43815 780 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 INHAP05111 366 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 FDX1P10109 184 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 COPB2P35606 906 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBXN2AP68543 259 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF543Q08ER8 600 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 MTFR1Q15390 333 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 CPXCR1Q8N123 301 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 APBA2Q99767 749 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADORA2AP29274 412 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC16A2P36021 539 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 OAZ1P54368 228 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANTXR2P58335 489 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF20Q5VTR2 975 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHST3Q7LGC8 479 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIB2Q92519 343 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIPK3Q9Y572 518 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 HMGCRP04035 888 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC4A3P48751 1232 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNAP25P60880 206 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERICH2A1L162 156 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 POTEFA5A3E0 1075 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF536O15090 1300 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 HOXC6P09630 235 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 FCER1AP12319 257 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM32Q13049 653 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCL14Q16627 93 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 MMP19Q99542 508 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCL5P13501 91 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 WTAPQ15007 396 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC174Q6PII3 467 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 DPP9Q86TI2 863 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SENP2Q9HC62 589 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 CENPFP49454 3210 aa20.89■□□□□ 0.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRC1O43663 620 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 COBLO75128 1261 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCTD2Q14681 263 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF208Q9H0X6 261 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.89■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 REC8O95072 547 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 MCM5P33992 734 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 RGS19P49795 217 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 RASEFQ8IZ41 740 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHST13Q8NET6 341 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 MTA3Q9BTC8 594 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2Q1-207ENST00000497453 FBXO40Q9UH90 709 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms