RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.99■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 MSCO60682 206 aa22.98■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 BMP3P12645 472 aa22.98■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 MAML3Q96JK9 1138 aa22.98■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.98■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 FDX1P10109 184 aa22.97■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 COL6A1P12109 1028 aa22.97■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 MMP19Q99542 508 aa22.97■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.97■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 HIP1O00291 1037 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 EVI5O60447 810 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 NMT2O60551 498 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 PLA2G6O60733 806 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 ZBED4O75132 1171 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 OAZ1P54368 228 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 KCTD2Q14681 263 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 RIPK3Q9Y572 518 aa22.96■■□□□ 1.27
USP40-217ENST00000496298 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 PDE4AP27815 886 aa22.95■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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USP40-217ENST00000496298 PFASO15067 1338 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 TMEM232C9JQI7 657 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 FAM160B2Q86V87 743 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.94■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 SEPT4O43236 478 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 PGK2P07205 417 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 MCCP23508 829 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 CNGA1P29973 690 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 SLC1A4P43007 532 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 STAT2P52630 851 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.93■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.92■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 CPXCR1Q8N123 301 aa22.92■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 TINF2Q9BSI4 451 aa22.92■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 PRO3102Q9H379 93 aa22.92■■□□□ 1.26
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USP40-217ENST00000496298 CHST13Q8NET6 341 aa22.9■■□□□ 1.26
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USP40-217ENST00000496298 TOMM22Q9NS69 142 aa22.9■■□□□ 1.26
USP40-217ENST00000496298 ZNF536O15090 1300 aa22.89■■□□□ 1.26
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USP40-217ENST00000496298 DNM1LO00429 736 aa22.89■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 ZNF213O14771 459 aa22.89■■□□□ 1.25
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USP40-217ENST00000496298 DCAF4Q8WV16 495 aa22.89■■□□□ 1.25
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USP40-217ENST00000496298 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.89■■□□□ 1.25
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USP40-217ENST00000496298 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.88■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 KCTD1Q719H9 257 aa22.88■■□□□ 1.25
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USP40-217ENST00000496298 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.88■■□□□ 1.25
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USP40-217ENST00000496298 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 ESR2Q92731 530 aa22.86■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 NEDD4P46934 1319 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 MCM3APO60318 1980 aa22.85■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
USP40-217ENST00000496298 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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