RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 FLT1P17948 1338 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 STXBP3O00186 592 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 NRDCO43847 1150 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 GTF2IP78347 998 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 NR1I3Q14994 352 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TC2NQ8N9U0 490 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 GSDMAQ96QA5 445 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 MXD3Q9BW11 206 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SPATA1Q5VX52 437 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 FEZ1Q99689 392 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CEP95Q96GE4 821 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SNED1Q8TER0 1413 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 BBOX1O75936 387 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 GNAQP50148 359 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PICALMQ13492 652 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 BARHL2Q9NY43 387 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GTH6 734 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 HSPA1LP34931 641 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 KCNJ6P48051 423 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 FANCGO15287 622 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SLURP2P0DP57 97 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 GDAQ9Y2T3 454 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 USP17L5A8MUK1 530 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TERF2Q15554 542 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PROM2Q8N271 834 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 LRRC15Q8TF66 581 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DNAI1Q9UI46 699 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 MTF1Q14872 753 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 MYH1P12882 1939 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 STAT6P42226 847 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 NAPAP54920 295 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PIGSQ96S52 555 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DESI2Q9BSY9 194 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DOK7Q18PE1 504 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CERS5Q8N5B7 392 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ERO1AQ96HE7 468 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 RBL2Q08999 1139 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 GAKO14976 1311 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-213ENST00000492657 SMCO2A6NFE2 343 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP6O43182 974 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 SCNN1DP51172 638 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 LETM2Q2VYF4 491 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 PLCG2P16885 1265 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-213ENST00000492657 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms