RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 USP38Q8NB14 1042 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 DDX11Q96FC9 970 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.62e-7■■■□□ 16.9
NELFE-210ENST00000491139 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 NCOR1O75376 2440 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 MFSD5Q6N075 450 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 CCDC174Q6PII3 467 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 GLT1D1Q96MS3 346 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 TBX21Q9UL17 535 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-210ENST00000491139 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 31
NELFE-210ENST00000491139 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ELP1O95163 1332 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 UBE3CQ15386 1083 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CTR9Q6PD62 1173 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 PANK1Q8TE04 598 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 VTI1AQ96AJ9 217 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 TNFRSF10AO00220 468 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ATP5JP18859 108 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 SPC25Q9HBM1 224 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 RIPK3Q9Y572 518 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 MYADML2A6NDP7 307 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 HMMRO75330 724 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 SLC4A3P48751 1232 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CDK7P50613 346 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ACVR2BQ13705 512 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 TMEM240Q5SV17 173 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 TMEM199Q8N511 208 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 MUC3AQ02505 3323 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 RAB11FIP3O75154 756 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CHGBP05060 677 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ASGR1P07306 291 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 HAUS7Q99871 368 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 PBX4Q9BYU1 374 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 F5H6K3 240 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ARVCFO00192 962 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ATP2A1O14983 1001 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 ZBED4O75132 1171 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CSF2RAP15509 400 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 PBX2P40425 430 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 KLRC3Q07444 240 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 RASIP1Q5U651 963 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 CPXCR1Q8N123 301 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 PPM1EQ8WY54 764 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 NYAP2Q9P242 653 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-210ENST00000491139 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 GNASQ5JWF2 1037 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 NDUFB10O96000 172 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 GJA9P57773 515 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 ZNF365Q70YC5 407 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 ADCY6O43306 1168 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 ACRP10323 421 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 COL9A1P20849 921 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 RASA1P20936 1047 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-210ENST00000491139 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms