RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 ADAMTS4O75173 837 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 RAG1P15918 1043 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 CPXCR1Q8N123 301 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 DDX11Q96FC9 970 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 VCANP13611 3396 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFB10O96000 172 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 COPB2P35606 906 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 SBK1Q52WX2 424 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 NYAP2Q9P242 653 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 MYH4Q9Y623 1939 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA0355O15063 1070 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 ACLYP53396 1101 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 FAAP100Q0VG06 881 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 OSBP2Q969R2 916 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 MYADML2A6NDP7 307 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 ZBED4O75132 1171 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 PRDM1O75626 825 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 KCNA10Q16322 511 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 KIFC2Q96AC6 838 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRN-217ENST00000489650 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 FPGSQ05932 587 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 MCM3APO60318 1980 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 M0R2C6 588 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 GPAA1O43292 621 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ADCY6O43306 1168 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 APPP05067 770 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 TDO2P48775 406 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ACVR2BQ13705 512 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 APPBP2Q92624 585 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 FOSL2P15408 326 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 CEP95Q96GE4 821 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 FGD4Q96M96 766 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 TOX2Q96NM4 488 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ATP2A1O14983 1001 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 MKL1Q969V6 931 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 FEM1BQ9UK73 627 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 TIMP1P01033 207 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ASGR1P07306 291 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRN-217ENST00000489650 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 GRIN2CQ14957 1233 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 SLFN13Q68D06 897 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 ARMCX2Q7L311 632 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRN-217ENST00000489650 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
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