RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 STXBP3O00186 592 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CTAGE5O15320 804 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CUTAO60888 179 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 BMP15O95972 392 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC192P0DO97 292 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SLURP2P0DP57 97 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CMA1P23946 247 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP2B2Q01814 1243 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF543Q08ER8 600 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM83AQ86UY5 434 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 BLIDQ8IZY5 108 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MKL1Q969V6 931 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 VEZTQ9HBM0 779 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 BARHL2Q9NY43 387 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM205CA6NFA0 338 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAPPC10P48553 1259 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ICA1Q05084 483 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SEPT2Q15019 361 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMK4Q16566 473 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC96Q2M329 555 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 DCAF4Q8WV16 495 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PANK2Q9BZ23 570 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CPVLQ9H3G5 476 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.89□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GVL5 298 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 WNT10BO00744 389 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GDF11O95390 407 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TNNI2P48788 182 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA8P51970 172 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 NAPAP54920 295 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC38Q5R3I4 469 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CST9Q5W186 159 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PIGSQ96S52 555 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.88□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ESYT2A0FGR8 921 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D12O60347 775 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GH2P01242 217 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PFKFB1P16118 471 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP2B1P20020 1258 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPREP23469 700 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 VEGFBP49765 207 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TYRO3Q06418 890 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 RESP18Q5W5W9 173 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SLFN13Q68D06 897 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 HOMER1Q86YM7 354 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF214Q8ND24 703 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 C6orf50Q9HD87 102 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH4Q9Y623 1939 aa11.87□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 H7C1D1 291 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 GNA11P29992 359 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC1A4P43007 532 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFAIP1Q13829 316 aa11.86□□□□□ -0.51
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.86□□□□□ -0.51
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