RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 FERMT2Q96AC1 680 aa9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TINF2Q9BSI4 451 aa9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 SWAP70Q9UH65 585 aa9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TNFRSF10AO00220 468 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ADAMTS4O75173 837 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 AKR1A1P14550 325 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 RAG1P15918 1043 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 DNAJB2P25686 324 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 FPGSQ05932 587 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 GRIN2CQ14957 1233 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 RASIP1Q5U651 963 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 CEP85Q6P2H3 762 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 VCPKMTQ9H867 229 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MYH7P12883 1935 aa9.25□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 GBF1Q92538 1859 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 FLOT1O75955 427 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TIMP1P01033 207 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 COPB2P35606 906 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 CDK7P50613 346 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 EMP3P54852 163 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 USP38Q8NB14 1042 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 REPS2Q8NFH8 660 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ATG4CQ96DT6 458 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC17Q96LX7 622 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MMP19Q99542 508 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF576Q9H609 170 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 SH2D4AQ9H788 454 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TBX21Q9UL17 535 aa9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 HMMRO75330 724 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 PGK1P00558 417 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 PDE6AP16499 860 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ACLYP53396 1101 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 NKX3-2P78367 333 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 PLCB2Q00722 1185 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MFSD5Q6N075 450 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ELP1O95163 1332 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.23□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 NCOR1O75376 2440 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 VWA5AO00534 786 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 AKR1B1P15121 316 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 COL9A1P20849 921 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 STAT3P40763 770 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 ICA1Q05084 483 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 PLS1Q14651 629 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 KCTD2Q14681 263 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM240Q5SV17 173 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 PANK1Q8TE04 598 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 TIFAQ96CG3 184 aa9.22□□□□□ -0.93
RBBP4-211ENST00000477563 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.937e-7■■□□□ 13.4
RBBP4-211ENST00000477563 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms