RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.88■□□□□ 0.93
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ATG4B-217ENST00000475693 GMCL1Q96IK5 515 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 GOPCQ9HD26 462 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 TCHHQ07283 1943 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 PCNTO95613 3336 aa20.87■□□□□ 0.93
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ATG4B-217ENST00000475693 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.84■□□□□ 0.93
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ATG4B-217ENST00000475693 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
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ATG4B-217ENST00000475693 WDR18Q9BV38 432 aa20.82■□□□□ 0.92
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ATG4B-217ENST00000475693 CCDC174Q6PII3 467 aa20.81■□□□□ 0.92
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ATG4B-217ENST00000475693 MTMR8Q96EF0 704 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 USP28Q96RU2 1077 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.8■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
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ATG4B-217ENST00000475693 PEX10O60683 326 aa20.79■□□□□ 0.92
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ATG4B-217ENST00000475693 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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ATG4B-217ENST00000475693 TREML2Q5T2D2 321 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 OPTNQ96CV9 577 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 CLIC4Q9Y696 253 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 FLOT1O75955 427 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 KRT2P35908 639 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.78■□□□□ 0.92
ATG4B-217ENST00000475693 PGBD1Q96JS3 809 aa20.78■□□□□ 0.92
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