RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 GMCL1Q96IK5 515 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 CYBAP13498 195 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 OAZ1P54368 228 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 KIFC2Q96AC6 838 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 MAML3Q96JK9 1138 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 STX8Q9UNK0 236 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
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NISCH-205ENST00000467594 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 INCENPQ9NQS7 918 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.28■□□□□ 0.52
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NISCH-205ENST00000467594 COL6A1P12109 1028 aa18.27■□□□□ 0.52
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NISCH-205ENST00000467594 NOVP48745 357 aa18.27■□□□□ 0.52
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NISCH-205ENST00000467594 CPXCR1Q8N123 301 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 TRPV1Q8NER1 839 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-205ENST00000467594 TOMM22Q9NS69 142 aa18.27■□□□□ 0.52
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NISCH-205ENST00000467594 PLA2G6O60733 806 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-205ENST00000467594 NT5C2P49902 561 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-205ENST00000467594 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.26■□□□□ 0.51
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NISCH-205ENST00000467594 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-205ENST00000467594 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
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NISCH-205ENST00000467594 TINF2Q9BSI4 451 aa18.25■□□□□ 0.51
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NISCH-205ENST00000467594 KCTD1Q719H9 257 aa18.22■□□□□ 0.51
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NISCH-205ENST00000467594 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.22■□□□□ 0.51
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NISCH-205ENST00000467594 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-205ENST00000467594 ESR2Q92731 530 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-205ENST00000467594 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.21■□□□□ 0.51
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NISCH-205ENST00000467594 A0A1W2PPC1 479 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 RARBP10826 455 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 PDE4AP27815 886 aa18.2■□□□□ 0.5
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NISCH-205ENST00000467594 CCDC96Q2M329 555 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 TTC22Q5TAA0 569 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 ACAD9Q9H845 621 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 AKR1A1P14550 325 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 LRRC26Q2I0M4 334 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-205ENST00000467594 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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