RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC41	Q15345	812 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	MROH8	Q9H579	483 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	RAD50	Q92878	1312 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A0D9SFI3	127 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FGR	P09769	529 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJB2	P25686	324 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TLE2	Q04725	743 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	COG2	Q14746	738 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NAPB	Q9H115	298 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TMX2	Q9Y320	296 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	CDH23	Q9H251	3354 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1W2PRG0	241 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FCER1A	P12319	257 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	RASA1	P20936	1047 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE4B	Q07343	736 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PPARA	Q07869	468 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PLS1	Q14651	629 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TIFA	Q96CG3	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF576	Q9H609	170 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PHF24	Q9UPV7	400 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA0355	O15063	1070 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	APP	P05067	770 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ERCC3	P19447	782 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SEPT2	Q15019	361 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ACER1	Q8TDN7	264 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ORC4	O43929	436 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC25A27	O95847	323 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	FGA	P02671	866 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NEFL	P07196	543 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	AKR1B1	P15121	316 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	COPB2	P35606	906 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PLA2G5	P39877	138 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ICA1	Q05084	483 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5	7e-7	■■■□□ 17
TTLL3-223	ENST00000466245	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MKL1	Q969V6	931 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	AKR1A1	P14550	325 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	NOV	P48745	357 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5

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