RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	GRK4	P32298	578 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CHST3	Q7LGC8	479 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	FAM160B2	Q86V87	743 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	CPXCR1	Q8N123	301 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		20.83	■□□□□ 0.93
USP19-210	ENST00000465902	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	ERCC3	P19447	782 aa		20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	CYP2B6	P20813	491 aa		20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	STAT3	P40763	770 aa		20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	NECTIN1	Q15223	517 aa		20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	PNMA1	Q8ND90	353 aa		20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		20.82	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	ELN	P15502	786 aa		20.81	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		20.81	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		20.81	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	MROH8	Q9H579	483 aa		20.81	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	GJD2	Q9UKL4	321 aa		20.81	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	BRCA2	P51587	3418 aa		20.81	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	REC8	O95072	547 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A27	O95847	323 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	PDHB	P11177	359 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	PTPRE	P23469	700 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A2	P36021	539 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	IRF5	Q13568	498 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	ANKS1A	Q92625	1134 aa		20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	20.8	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	RGS2	P41220	211 aa		20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SNAP25	P60880	206 aa		20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	REPS2	Q8NFH8	660 aa		20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	20.79	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G6	O60733	806 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	FDX1	P10109	184 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	ZNF543	Q08ER8	600 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	MAP2K5	Q13163	448 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	WTAP	Q15007	396 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SEC23A	Q15436	765 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	MORN1	Q5T089	497 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	CCDC174	Q6PII3	467 aa		20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	20.78	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	MYH6	P13533	1939 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	PRC1	O43663	620 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	STRN	O43815	780 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	FCER1A	P12319	257 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	MCM5	P33992	734 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	COPB2	P35606	906 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	UBXN2A	P68543	259 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	DPP9	Q86TI2	863 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		20.77	■□□□□ 0.92
USP19-210	ENST00000465902	INHA	P05111	366 aa		20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	ADORA2A	P29274	412 aa		20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	GRB14	Q14449	540 aa		20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	MMP19	Q99542	508 aa		20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	RIPK3	Q9Y572	518 aa		20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		20.76	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	SNHG28	P0DPA3	235 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	OAZ1	P54368	228 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	ANTXR2	P58335	489 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	KCTD2	Q14681	263 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	USP6NL	Q92738	828 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	NEK1	Q96PY6	1258 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	APBA2	Q99767	749 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		20.75	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	ATP2A1	O14983	1001 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	HMGCR	P04035	888 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	KRT32	Q14532	448 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	MTFR1	Q15390	333 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	CCL14	Q16627	93 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	RASEF	Q8IZ41	740 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	TRIB2	Q92519	343 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		20.74	■□□□□ 0.91
USP19-210	ENST00000465902	CPVL	Q9H3G5	476 aa		20.74	■□□□□ 0.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms