RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 KDRP35968 1356 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP27B1O15528 508 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 BMP8BP34820 402 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 PREPP48147 710 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 FDX2Q6P4F2 183 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 OLFM4Q6UX06 510 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 TDHQ8IZJ6 230 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ATG3Q9NT62 314 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR64B1ANS9 1081 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ARL4DP49703 201 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 NLRP12P59046 1061 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 SHISA4Q96DD7 197 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 GDF15Q99988 308 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMYND15Q9H091 742 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTN3Q9P232 1028 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CES1P23141 567 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 IP6K1Q92551 441 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ERO1AQ96HE7 468 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 COL4A5P29400 1685 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF609O15014 1411 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ADM5C9JUS6 153 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 ATG7O95352 703 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 TM4SF4P48230 202 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 STYK1Q6J9G0 422 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 MYLIPQ8WY64 445 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 MRC1P22897 1456 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 ACPPP15309 386 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 FOSL2P15408 326 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP3K11Q16584 847 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 ATCAYQ86WG3 371 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC16Q8NEE8 873 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 MASTLQ96GX5 879 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 MEGF11A6BM72 1044 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 NPHP1O15259 732 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 PCSK2P16519 638 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SREBF2Q12772 1141 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 XKR5Q6UX68 686 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 EDEM1Q92611 657 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 NBPF4Q96M43 638 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SRGNP10124 158 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 NHLH1Q02575 133 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 C8orf34Q49A92 452 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 SGO2Q562F6 1265 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXL6Q8N531 539 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms