RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456467.1

SIX3-AS1-202, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 557 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.81■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.81■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.81■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GOLIM4O00461 696 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RAD21O60216 631 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ASGR1P07306 291 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 THEGQ9P2T0 379 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SWAP70Q9UH65 585 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 USP17L12C9JPN9 530 aa15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 USP17L21D6R901 530 aa15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RLBP1P12271 317 aa15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PTGS1P23219 599 aa15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RABGGTBP53611 331 aa15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C12orf60Q5U649 245 aa15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.79■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ELP1O95163 1332 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MOXD2PA6NHM9 499 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARVCFO00192 962 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CTAGE5O15320 804 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BMP1P13497 986 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MYOGP15173 224 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PLA2G5P39877 138 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TFF2Q03403 129 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ACVR2BQ13705 512 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DDX11Q96FC9 970 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 APBB1O00213 710 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MBD4O95243 580 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BEX3Q00994 111 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GNASQ5JWF2 1037 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CEP85Q6P2H3 762 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CPXCR1Q8N123 301 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMEM199Q8N511 208 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM122AQ96E09 287 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CCDC17Q96LX7 622 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FGD4Q96M96 766 aa15.77■□□□□ 0.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RFXAPO00287 272 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CD4P01730 458 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FGBP02675 491 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GJA9P57773 515 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HERVK_113Q902F9 699 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 VWCEQ96DN2 955 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SH2D4AQ9H788 454 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IL23AQ9NPF7 189 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MSRAQ9UJ68 235 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 REV3LO60673 3130 aa15.76■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CCL23P55773 120 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PARP14Q460N5 1801 aa15.75■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GRIN2DO15399 1336 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NAV1Q8NEY1 1877 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 F5H6K3 240 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KCNQ1P51787 676 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CNTN2Q02246 1040 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KLRC3Q07444 240 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CTR9Q6PD62 1173 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms