RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD1Q719H9 257 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 PNMA1Q8ND90 353 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 KIFC2Q96AC6 838 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 ADCY3O60266 1144 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 REC8O95072 547 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF543Q08ER8 600 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 PLS1Q14651 629 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 ABRAQ8N0Z2 381 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF333Q96JL9 665 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX13BQ9BXU2 312 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGEF1-204ENST00000442563 ERICH2A1L162 156 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 RGS2P41220 211 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP2K5Q13163 448 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 GRB14Q14449 540 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC96Q2M329 555 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 NCAPG2Q86XI2 1143 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNB2Q92953 911 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR12Q9ULL5 1215 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 MTMR7Q9Y216 660 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0G2JMZ2 1700 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 PARP14Q460N5 1801 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXC6P09630 235 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 MCM5P33992 734 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR78Q5VTH9 848 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 SH3TC2Q8TF17 1288 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 DOCK3Q8IZD9 2030 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP2B6P20813 491 aa19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 ANTXR2P58335 489 aa19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT32Q14532 448 aa19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 TTBK2Q6IQ55 1244 aa19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 RASGRP2Q7LDG7 609 aa19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.74■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 FCER1AP12319 257 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPA4P34932 840 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 UBXN2AP68543 259 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 WTAPQ15007 396 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 ASPRV1Q53RT3 343 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 CPXCR1Q8N123 301 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 TMTC2Q8N394 836 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM87BQ96K49 555 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 NEK1Q96PY6 1258 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 PNMA2Q9UL42 364 aa19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC16A2P36021 539 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 TKFCQ3LXA3 575 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 CHST3Q7LGC8 479 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 RASEFQ8IZ41 740 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 CHST13Q8NET6 341 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 APBA2Q99767 749 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO40Q9UH90 709 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 RIPK3Q9Y572 518 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF536O15090 1300 aa19.72■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 PRC1O43663 620 aa19.71■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 ELNP15502 786 aa19.71■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 ADORA2AP29274 412 aa19.71■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC5A4Q9NY91 659 aa19.71■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR19Q8NEZ3 1342 aa19.71■□□□□ 0.75
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPN15O75808 1086 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGCRP04035 888 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 INHAP05111 366 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 LIFRP42702 1097 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD2Q14681 263 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 DPP9Q86TI2 863 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 MMP19Q99542 508 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM106CQ9BVX2 250 aa19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 COBLO75128 1261 aa19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHA2P01877 340 aa19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 ICAM1P05362 532 aa19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 TROAPQ12815 778 aa19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 CATIPQ7Z7H3 387 aa19.69■□□□□ 0.74
RABGEF1-204ENST00000442563 NPLOC4Q8TAT6 608 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms