RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 ELP1O95163 1332 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 GOLIM4O00461 696 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 RLBP1P12271 317 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 STAT3P40763 770 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 CHST13Q8NET6 341 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 MKL1Q969V6 931 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PNMA2Q9UL42 364 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-204ENST00000440835 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 VWA5AO00534 786 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 PLA2G6O60733 806 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 CLTBP09497 229 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 REPS2Q8NFH8 660 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ATG4CQ96DT6 458 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SPC25Q9HBM1 224 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 MYH4Q9Y623 1939 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ZBED4O75132 1171 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 CABYRO75952 493 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 MBD4O95243 580 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 AKR1B1P15121 316 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 NT5C2P49902 561 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 GUCD1Q96NT3 240 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 FEM1BQ9UK73 627 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 PLS1Q14651 629 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ARMT1Q9H993 441 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 USP17L12C9JPN9 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 USP17L21D6R901 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 PEX10O60683 326 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 FPGSQ05932 587 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM60Q495X7 471 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRR-204ENST00000440835 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 Q9Y3F1 56 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRR-204ENST00000440835 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1W2PQY0 241 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRR-204ENST00000440835 CTR9Q6PD62 1173 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 FAM160B2Q86V87 743 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRR-204ENST00000440835 FSD2A1L4K1 749 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 TIMP1P01033 207 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 GJA9P57773 515 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 TLE2Q04725 743 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 SHHQ15465 462 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 C8orf34Q49A92 452 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 Q7L0L9 218 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 APPBP2Q92624 585 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 BADQ92934 168 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-204ENST00000440835 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.12□□□□□ -1.27
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