RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 USP17L12C9JPN9 530 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 USP17L21D6R901 530 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SMIM22K7EJ46 135 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GOLIM4O00461 696 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ADD2P35612 726 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC174Q6PII3 467 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PBX4Q9BYU1 374 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ARMT1Q9H993 441 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GOPCQ9HD26 462 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 MBD4O95243 580 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 COL9A1P20849 921 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GJA9P57773 515 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 UBE3CQ15386 1083 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CTR9Q6PD62 1173 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ASB2Q96Q27 587 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 RIPK3Q9Y572 518 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 MYADML2A6NDP7 307 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ARVCFO00192 962 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CTAGE5O15320 804 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CD4P01730 458 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CSF2RAP15509 400 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ATP5JP18859 108 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PBX2P40425 430 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ACVR2BQ13705 512 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ADGRE1Q14246 886 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM199Q8N511 208 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 HERVK_113Q902F9 699 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 FGD4Q96M96 766 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 HAUS7Q99871 368 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 NYAP2Q9P242 653 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 F5H6K3 240 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ADCY6O43306 1168 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ASGR1P07306 291 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 RASA1P20936 1047 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 KLRC3Q07444 240 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 RAB30Q15771 203 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SBK1Q52WX2 424 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GIMAP6Q6P9H5 292 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF365Q70YC5 407 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 MKL1Q969V6 931 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 DDX11Q96FC9 970 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 KATNBL1Q9H079 304 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SPC25Q9HBM1 224 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 IL23AQ9NPF7 189 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 THEGQ9P2T0 379 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 ZBED4O75132 1171 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 RAB11FIP3O75154 756 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CABYRO75952 493 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 NDUFB10O96000 172 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 OAZ1P54368 228 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 GNASQ5JWF2 1037 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 CHST13Q8NET6 341 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 FBXO40Q9UH90 709 aa9.47□□□□□ -0.89
LINC00578-201ENST00000439009 MSRAQ9UJ68 235 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms