RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433358.5

NME4-204, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, human

TSL 3

Gene NME4, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME4-204	ENST00000433358	PGK2	P07205	417 aa		27.63	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	BMP3	P12645	472 aa		27.63	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	SDS	P20132	328 aa		27.63	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		27.63	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	CPXCR1	Q8N123	301 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	ORC4	O43929	436 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	NMT2	O60551	498 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	PRO3102	Q9H379	93 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	STX8	Q9UNK0	236 aa		27.61	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	NOV	P48745	357 aa		27.6	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	SLC4A3	P48751	1232 aa		27.6	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	GMCL1	Q96IK5	515 aa		27.6	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		27.6	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	TMEM232	C9JQI7	657 aa		27.59	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	SEPT4	O43236	478 aa		27.59	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	MCC	P23508	829 aa		27.59	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		27.59	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	ANO1	Q5XXA6	986 aa		27.58	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		27.58	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	TINF2	Q9BSI4	451 aa		27.58	■■■□□ 2.01
NME4-204	ENST00000433358	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	SLC1A4	P43007	532 aa		27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	DDX11	Q96FC9	970 aa		27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	TOMM22	Q9NS69	142 aa		27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	ZMYM6	O95789	1325 aa		27.57	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	FDX1	P10109	184 aa		27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	STAT2	P52630	851 aa		27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	OAZ1	P54368	228 aa		27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	HAND2	P61296	217 aa		27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	FAM160B2	Q86V87	743 aa		27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		27.55	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	DNM1L	O00429	736 aa		27.55	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	PLA2G6	O60733	806 aa		27.55	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		27.55	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	MYH4	Q9Y623	1939 aa		27.55	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	KCTD1	Q719H9	257 aa		27.54	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2	3e-8	■■■■■ 32.6
NME4-204	ENST00000433358	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		27.54	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	SYN1	P17600	705 aa		27.53	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	CHST13	Q8NET6	341 aa		27.53	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		27.53	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	FBXO40	Q9UH90	709 aa		27.53	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	ZNF536	O15090	1300 aa		27.52	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	ALPK3	Q96L96	1907 aa		27.52	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	PDE4A	P27815	886 aa		27.52	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		27.52	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		27.52	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		27.52	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	MTMR7	Q9Y216	660 aa		27.52	■■■□□ 2
NME4-204	ENST00000433358	HIP1	O00291	1037 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	GDF15	Q99988	308 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	CEP290	O15078	2479 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	ZNF213	O14771	459 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		27.5	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	SNAP25	P60880	206 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	DCAF4	Q8WV16	495 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		27.49	■■□□□ 1.99
NME4-204	ENST00000433358	KBTBD13	C9JR72	458 aa		27.48	■■□□□ 1.99

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