RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 MMP19Q99542 508 aa21.65■■□□□ 1.06
LRRC23-204ENST00000428946 IL25Q9H293 177 aa21.65■■□□□ 1.06
LRRC23-204ENST00000428946 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.65■■□□□ 1.06
LRRC23-204ENST00000428946 PGK2P07205 417 aa21.64■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 FCER1AP12319 257 aa21.64■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.64■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.64■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.64■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 TSPY2A6NKD2 308 aa21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SLC25A27O95847 323 aa21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 STAT3P40763 770 aa21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 MKL1Q969V6 931 aa21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 MAML3Q96JK9 1138 aa21.63■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ZMYM6O95789 1325 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 NMT2O60551 498 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 TTLL1O95922 423 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 FGRP09769 529 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SLC4A3P48751 1232 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 TOMM22Q9NS69 142 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.62■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.61■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ORC4O43929 436 aa21.61■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 MSCO60682 206 aa21.61■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 CHMLP26374 656 aa21.61■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.61■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SZT2Q5T011 3432 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 KCTD2Q14681 263 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 CPXCR1Q8N123 301 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 KIFC2Q96AC6 838 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF213O14771 459 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 GDF15Q99988 308 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 STX8Q9UNK0 236 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 RIPK3Q9Y572 518 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 MCM3APO60318 1980 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 DNM1LO00429 736 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 SEPT4O43236 478 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF792Q3KQV3 632 aa21.57■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 SLFN13Q68D06 897 aa21.57■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.57■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.57■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 COPB2P35606 906 aa21.56■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.56■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.56■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 ZBED4O75132 1171 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 NEFLP07196 543 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 BMP3P12645 472 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 LRCH3Q96II8 777 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 TINF2Q9BSI4 451 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 FEM1BQ9UK73 627 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 NEDD4P46934 1319 aa21.55■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 LAMA3Q16787 3333 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 A0A1W2PPC1 479 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 KBTBD13C9JR72 458 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 MCCP23508 829 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 NOVP48745 357 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 PTH1RQ03431 593 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 MTMR7Q9Y216 660 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 LTBP2Q14767 1821 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 RAD50Q92878 1312 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM232C9JQI7 657 aa21.53■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 SGSM2O43147 1006 aa21.53■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 BMP8BP34820 402 aa21.53■■□□□ 1.04
LRRC23-204ENST00000428946 RTP1P59025 263 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms