RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 FAM160B2Q86V87 743 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 BTBD19C9JJ37 291 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SREBF2Q12772 1141 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF11Q86T75 865 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 KIFC2Q96AC6 838 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 CDKL5O76039 1030 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 ZIC5Q96T25 663 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2G6O60733 806 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 AOC2O75106 756 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PPFIA3O75145 1194 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 INHBEP58166 350 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 NTRK3Q16288 839 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PTPN18Q99952 460 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PDHXO00330 501 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 CYTH3O43739 400 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 IFNAR1P17181 557 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 OSBPP22059 807 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 COG2Q14746 738 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PHKBQ93100 1093 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PNMA3Q9UL41 463 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 DTNBO60941 627 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCA1P28370 1054 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 CUL4AQ13619 759 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXA4-202ENST00000428284 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 CTDNEP1O95476 244 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 FUT2Q10981 343 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 HOMER1Q86YM7 354 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 DSG3P32926 999 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 IFNL1Q8IU54 200 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 ATG4CQ96DT6 458 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 MYPNQ86TC9 1320 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 JAK2O60674 1132 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 MAP2K2P36507 400 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 DDX11Q96FC9 970 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
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HOXA4-202ENST00000428284 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 TM4SF4P48230 202 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SNAP25P60880 206 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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HOXA4-202ENST00000428284 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 PCNTO95613 3336 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 CYP2C8P10632 490 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 HERVK_113P62684 666 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 VWA5AO00534 786 aa23.85■■□□□ 1.41
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