RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHB10Q9UN67 800 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 FITM1A5D6W6 292 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 CCNFP41002 786 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ARID5AQ03989 594 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 DUSP4Q13115 394 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PKN1Q16512 942 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 RNF111Q6ZNA4 994 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF605Q86T29 641 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 OXR1Q8N573 874 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 SPATA32Q96LK8 384 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 SLC38A3Q99624 504 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 DSCC1Q9BVC3 393 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 CDADC1Q9BWV3 514 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF281Q9Y2X9 895 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 LTBP3Q9NS15 1303 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 H0Y8X5 98 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 IMPDH2P12268 514 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 GUCY2CP25092 1073 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PDE6BP35913 854 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 GJA8P48165 433 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PMS1P54277 932 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 CEP128Q6ZU80 1094 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 C7orf61Q8IZ16 206 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 LINC00116Q8NCU8 138 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ADCY4Q8NFM4 1077 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 TM9SF2Q99805 663 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ATP2B1P20020 1258 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 SOX9P48436 509 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF445P59923 1031 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 CHRNEQ04844 493 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 FZD5Q13467 585 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 SLC14A2Q15849 920 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 PPP2R5EQ16537 467 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 RASGRP4Q8TDF6 673 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 DHRS1Q96LJ7 313 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 CRBNQ96SW2 442 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 SGPP1Q9BX95 441 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 ZNF205O95201 554 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 GSTM1P09488 218 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 RAP1GAPP47736 663 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 ADGRF1Q5T601 910 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 NLRX1Q86UT6 975 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 SPPL2CQ8IUH8 684 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 ZDHHC15Q96MV8 337 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-208ENST00000427110 MCOLN1Q9GZU1 580 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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