RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKN1Q16512 942 aa19.59■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
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TOP3BP1-201ENST00000420768 WNK4Q96J92 1243 aa19.59■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPVLQ9H3G5 476 aa19.59■□□□□ 0.73
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TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L13C9JLJ4 530 aa19.57■□□□□ 0.72
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.56■□□□□ 0.72
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TOP3BP1-201ENST00000420768 AIFM3Q96NN9 605 aa19.56■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa19.56■□□□□ 0.72
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 COG2Q14746 738 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGMBQ6NW40 437 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 GADL1Q6ZQY3 521 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO28Q9NVF7 368 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 BARHL2Q9NY43 387 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa19.55■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH4Q9Y623 1939 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRD1O95696 1058 aa19.54■□□□□ 0.72
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TOP3BP1-201ENST00000420768 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC148Q8NFR7 591 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 MS4A4AQ96JQ5 239 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXC10Q9NYD6 342 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNMA2Q9UL42 364 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTMR6Q9Y217 621 aa19.54■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKP1Q13835 747 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 TREML2Q5T2D2 321 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT40Q6A162 431 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 WWC2Q6AWC2 1192 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R18Q6NYC8 613 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASAL3Q86YV0 1011 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMNQ9BXJ7 453 aa19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 STXBP3O00186 592 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBED4O75132 1171 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 DSG3P32926 999 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO11Q86XK2 927 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC102AQ96A19 550 aa19.52■□□□□ 0.72
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TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS54Q9P1Q0 977 aa19.52■□□□□ 0.72
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