RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 CRKP46108 304 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 DPYDQ12882 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 IDI2Q9BXS1 227 aa22.93■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 KCNJ6P48051 423 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 LRMPQ12912 555 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 F8W031 263 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SHMT1P34896 483 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 NAPAP54920 295 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SLC15A2Q16348 729 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 DACT2Q5SW24 774 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 ISM2Q6H9L7 571 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.92■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 AKR1B1P15121 316 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SLX4Q8IY92 1834 aa22.91■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTS3O15072 1205 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 MYL1P05976 194 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF18P17022 549 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 IL17AQ16552 155 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SOGA3Q5TF21 947 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 AK8Q96MA6 479 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 UBASH3AP57075 661 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.264e-8■■■■■ 28
SUMO3-204ENST00000411651 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L5A8MUK1 530 aa22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 NRDCO43847 1150 aa22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SCNN1DP51172 638 aa22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CCZ1BP86790 482 aa22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 MSL1Q68DK7 614 aa22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.89■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SMCO2A6NFE2 343 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 ECE2O60344 883 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 FANCLQ9NW38 375 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINC1P01008 464 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 ATP1A3P13637 1013 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 MXD3Q9BW11 206 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 STK32BQ9NY57 414 aa22.88■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SKILP12757 684 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF543Q08ER8 600 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 INF2Q27J81 1249 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 PIGSQ96S52 555 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CUEDC2Q9H467 287 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 RMND1Q9NWS8 449 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.87■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 TMC6Q7Z403 805 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 VSTM4Q8IW00 320 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 DISC1Q9NRI5 854 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SCN9AQ15858 1988 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CUL4BQ13620 913 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 NEK8Q86SG6 692 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 MKL1Q969V6 931 aa22.86■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SIPA1L1O43166 1804 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 AFMP43652 599 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 MTMR7Q9Y216 660 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.85■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 PSME4Q14997 1843 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 NFIAQ12857 509 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 CFAP100Q494V2 611 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 SPATA1Q5VX52 437 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 HOMER1Q86YM7 354 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 MTMR8Q96EF0 704 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 OR52Z1P0C646 297 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 NYAP2Q9P242 653 aa22.84■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.83■■□□□ 1.25
SUMO3-204ENST00000411651 DYNC1I1O14576 645 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-204ENST00000411651 ENTPD3O75355 529 aa22.82■■□□□ 1.24
SUMO3-204ENST00000411651 STAT6P42226 847 aa22.82■■□□□ 1.24
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