RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 PALLDQ8WX93 1383 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 CYP11A1P05108 521 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 MAOBP27338 520 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 USP11P51784 963 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 NFKBIBQ15653 356 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.59□□□□□ -1.03
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CCL20-202ENST00000409189 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL20-202ENST00000409189 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 GLTPD2A6NH11 291 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 IGHA2P01877 340 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ZNF576Q9H609 170 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 H3BRB1 525 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB4P48594 390 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
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CCL20-202ENST00000409189 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 C4AP0C0L4 1744 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 NEFLP07196 543 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 MORC1Q86VD1 984 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 NGEFQ8N5V2 710 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.56□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ITGB4P16144 1822 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ECEL1O95672 775 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 CBLL1Q75N03 491 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 CFAP53Q96M91 514 aa8.55□□□□□ -1.04
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CCL20-202ENST00000409189 NUDCQ9Y266 331 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 PASKQ96RG2 1323 aa8.54□□□□□ -1.04
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CCL20-202ENST00000409189 CHRNA5P30532 468 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ORC1Q13415 861 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ITPK1Q13572 414 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 MAP7Q14244 749 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 NME9Q86XW9 330 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ABCB6Q9NP58 842 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 NPHS2Q9NP85 383 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 CYP26A1O43174 497 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 NFICP08651 508 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 FBXL18Q96ME1 805 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCL20-202ENST00000409189 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 CORO1BQ9BR76 489 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 EHD4Q9H223 541 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 FYB1O15117 783 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 GPR182O15218 404 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 GYS1P13807 737 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 RAB6AP20340 208 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 LMNB1P20700 586 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 COL19A1Q14993 1142 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 DYMQ7RTS9 669 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 PIGBQ92521 554 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 IP6K1Q92551 441 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 WDR18Q9BV38 432 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 AOC2O75106 756 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL20-202ENST00000409189 FBLN1P23142 703 aa8.5□□□□□ -1.05
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