RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKS1AQ92625 1134 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP95Q96GE4 821 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CPVLQ9H3G5 476 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM75PA6NK02 468 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 BIN1O00499 593 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CUTAO60888 179 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SLURP2P0DP57 97 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MSNP26038 577 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CRKP46108 304 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 BAG6P46379 1132 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NT5C2P49902 561 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GNAQP50148 359 aa4.56□□□□□ -1.68
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LRRTM4-201ENST00000409088 USP46P62068 366 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIN1Q05586 938 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE4CQ08493 712 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TCP10Q12799 353 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NFIAQ12857 509 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GRM4Q14833 912 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 STX1AQ16623 288 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ISM2Q6H9L7 571 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L2Q6R6M4 530 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM33Q9BZ11 813 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 VAT1LQ9HCJ6 419 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ANO10Q9NW15 660 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MAST2Q6P0Q8 1798 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 BECN2A8MW95 431 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KLRF2D3W0D1 207 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF174Q15697 407 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NPY5RQ15761 445 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RESP18Q5W5W9 173 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.56□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 WNT7AO00755 349 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTS3O15072 1205 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIP5K2O43314 1243 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CYTH3O43739 400 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 AKR1B1P15121 316 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP2B2Q01814 1243 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 LONRF3Q496Y0 759 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 HS1BP3Q53T59 392 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DACT2Q5SW24 774 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 HOMER1Q86YM7 354 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PDILTQ8N807 584 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SPC24Q8NBT2 197 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CNNM3Q8NE01 707 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 C7orf43Q8WVR3 580 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 HPSEQ9Y251 543 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.55□□□□□ -1.68
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LRRTM4-201ENST00000409088 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 GABPAQ06546 454 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.55□□□□□ -1.68
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LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM5Q9C035 493 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM13BQ9NYF5 915 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.55□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM196BA6NMK8 535 aa4.55□□□□□ -1.68
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