RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOCS4Q8WXH5 440 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIFC2Q96AC6 838 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MROH8Q9H579 483 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNMA2Q9UL42 364 aa17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.9■□□□□ 0.46
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.89■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 REPS2Q8NFH8 660 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.89■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.89■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTMR7Q9Y216 660 aa17.88■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADCK5Q3MIX3 580 aa17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYDE2Q5VT97 1194 aa17.87■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SGMS1Q86VZ5 419 aa17.87■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLS1Q14651 629 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa17.86■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC69A6NI79 296 aa17.85■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX10O60683 326 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLT3LGP49771 235 aa17.85■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXL16Q8N461 479 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAET1EQ8TD07 263 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO40Q9UH90 709 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GJD2Q9UKL4 321 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPREP23469 700 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF5BP33176 963 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRB14Q14449 540 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRM4Q14833 912 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C8orf34Q49A92 452 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MORN1Q5T089 497 aa17.84■□□□□ 0.45
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTBK2Q6IQ55 1244 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLAIN1Q8ND83 568 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PXYLP1Q8TE99 480 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ICAM1P05362 532 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA8HP0CJ92 632 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS6KB1P23443 525 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC16A2P36021 539 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS2P41220 211 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNAQP50148 359 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCAN1P53805 252 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR78Q5VTH9 848 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF11Q86T75 865 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
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