RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.11■■□□□ 1.77
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CHST6-202ENST00000390664 CUTAO60888 179 aa26.11■■□□□ 1.77
CHST6-202ENST00000390664 NDUFA8P51970 172 aa26.11■■□□□ 1.77
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CHST6-202ENST00000390664 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
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CHST6-202ENST00000390664 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.11■■□□□ 1.77
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CHST6-202ENST00000390664 C6orf50Q9HD87 102 aa26.08■■□□□ 1.77
CHST6-202ENST00000390664 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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CHST6-202ENST00000390664 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.08■■□□□ 1.77
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CHST6-202ENST00000390664 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.08■■□□□ 1.77
CHST6-202ENST00000390664 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CHST6-202ENST00000390664 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.07■■□□□ 1.76
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CHST6-202ENST00000390664 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.03■■□□□ 1.76
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CHST6-202ENST00000390664 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.03■■□□□ 1.76
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CHST6-202ENST00000390664 BMP3P12645 472 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 MCM7P33993 719 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 PTGDRQ13258 359 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 SPECC1Q5M775 1068 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 ACER1Q8TDN7 264 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 GOPCQ9HD26 462 aa26.02■■□□□ 1.76
CHST6-202ENST00000390664 ASNSP08243 561 aa26.01■■□□□ 1.75
CHST6-202ENST00000390664 INF2Q27J81 1249 aa26.01■■□□□ 1.75
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