RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAD21O60216 631 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAMTS4O75173 837 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACLYP53396 1101 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAAP100Q0VG06 881 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMIM22K7EJ46 135 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERC2O15083 957 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAJB2P25686 324 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRIN2CQ14957 1233 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE3CQ15386 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 REPS2Q8NFH8 660 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX11Q96FC9 970 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 TIMP1P01033 207 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 MX1P20591 662 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNA10Q16322 511 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTR9Q6PD62 1173 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC174Q6PII3 467 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 TIFAQ96CG3 184 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF576Q9H609 170 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3-204ENST00000373166 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ELP1O95163 1332 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFSD5Q6N075 450 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.251e-7■■■■■ 27.7
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPC25Q9HBM1 224 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBX21Q9UL17 535 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 13.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 29.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 F5H6K3 240 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHGBP05060 677 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC4A3P48751 1232 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLRC3Q07444 240 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACVR2BQ13705 512 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP38Q8NB14 1042 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 NYAP2Q9P242 653 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIPK3Q9Y572 518 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP2A1O14983 1001 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBED4O75132 1171 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDK7P50613 346 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPXCR1Q8N123 301 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM199Q8N511 208 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYADML2A6NDP7 307 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 NDUFB10O96000 172 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASGR1P07306 291 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM240Q5SV17 173 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMC5Q8IY18 1101 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-204ENST00000373166 APPBP2Q92624 585 aa22.84■■□□□ 1.25
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