RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ASIC2Q16515 512 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DOK7Q18PE1 504 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LONRF3Q496Y0 759 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF365Q70YC5 407 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 YY1AP1Q9H869 796 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 RESTQ13127 1097 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 STIM2Q9P246 746 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KCNJ18B7U540 433 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TNFAIP3P21580 790 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LIFRP42702 1097 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KCNJ12Q14500 433 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 BRD3Q15059 726 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MCAMP43121 646 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SATB1Q01826 763 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MORC3Q14149 939 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MYCT1Q8N699 235 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CABS1Q96KC9 395 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NOX5Q96PH1 765 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FNBP1Q96RU3 617 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC77Q9BR77 488 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PTPRMP28827 1452 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PLCB3Q01970 1234 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 BIRC3Q13489 604 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SPATA1Q5VX52 437 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NSMFQ6X4W1 530 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CSRNP2Q9H175 543 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TRAPPC10P48553 1259 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 H7C1D1 291 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GCNT3O95395 438 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CEP120Q8N960 986 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CFAP58Q5T655 872 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 EXOC4Q96A65 974 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 EXOC3O60645 756 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 28.8
PTPRK-204ENST00000368210 MAP3K9P80192 1104 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NIM1KQ8IY84 436 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GSDMAQ96QA5 445 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 GBP1P32455 592 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NR5A1Q13285 461 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 IQCDQ96DY2 449 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 A0A1W2PRG0 241 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MMP1P03956 469 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 DNM2P50570 870 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 WDR44Q5JSH3 913 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 FAM182BQ5T319 152 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 C8orf74Q6P047 294 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 RRAGAQ7L523 313 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 KIFC2Q96AC6 838 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 TTC14Q96N46 770 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-204ENST00000368210 CRB1P82279 1406 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms