RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 TKFCQ3LXA3 575 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 MORN1Q5T089 497 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 GPR142Q7Z601 462 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ATG4CQ96DT6 458 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM87BQ96K49 555 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 KAT14Q9H8E8 782 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXO40Q9UH90 709 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 TNKSO95271 1327 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM232C9JQI7 657 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 RAD21O60216 631 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPREP23469 700 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 GRK4P32298 578 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 RGS2P41220 211 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 LIFRP42702 1097 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 PRKCZQ05513 592 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF543Q08ER8 600 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 SKAP1Q86WV1 359 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 PNMA1Q8ND90 353 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF333Q96JL9 665 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 PORCNQ9H237 461 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 UBXN2AP68543 259 aa14.3□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP2K5Q13163 448 aa14.3□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CHST13Q8NET6 341 aa14.3□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 BRCA2P51587 3418 aa14.3□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ADCY3O60266 1144 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 FCER1AP12319 257 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ERCC3P19447 782 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 HSPA4P34932 840 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 RGS19P49795 217 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAF1Q13077 416 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXL16Q8N461 479 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 APBA2Q99767 749 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 HMGCRP04035 888 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 SMARCA1P28370 1054 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 RCAN1P53805 252 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 WTAPQ15007 396 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 KIFC2Q96AC6 838 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 GABRQQ9UN88 632 aa14.28□□□□□ -0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 IGHA2P01877 340 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ICAM1P05362 532 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CALM1P0DP23 149 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CALM2P0DP24 149 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CALM3P0DP25 149 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PLS1Q14651 629 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 KCTD2Q14681 263 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC96Q2M329 555 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 KCTD1Q719H9 257 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 NEK1Q96PY6 1258 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 DDAH1O94760 285 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PSMA5P28066 241 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 KIF5BP33176 963 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TROAPQ12815 778 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP2R5BQ15173 497 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 RGS22Q8NE09 1264 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PLXNB2O15031 1838 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNQ1-203ENST00000345015 PFASO15067 1338 aa14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms