RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 KLRC3Q07444 240 aa25.16■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.16■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 RNF180Q86T96 592 aa25.16■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 BADQ92934 168 aa25.16■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 PGK1P00558 417 aa25.15■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 AKR1A1P14550 325 aa25.15■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.15■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.15■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 SHHQ15465 462 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.14■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 PRDM1O75626 825 aa25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 TLE2Q04725 743 aa25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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SOCS1-201ENST00000332029 GUCD1Q96NT3 240 aa25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 RIPK3Q9Y572 518 aa25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 KIFC2Q96AC6 838 aa25.12■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 FAM161BQ96MY7 647 aa25.12■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.12■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1W2PQY0 241 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ATP2A1O14983 1001 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ZBED4O75132 1171 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 SLC4A3P48751 1232 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 CPXCR1Q8N123 301 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 CEP95Q96GE4 821 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.11■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.1■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ADAMTS4O75173 837 aa25.1■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 CLTBP09497 229 aa25.1■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 MKL1Q969V6 931 aa25.1■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.1■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.1■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 TTLL1O95922 423 aa25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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SOCS1-201ENST00000332029 FEM1BQ9UK73 627 aa25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.09■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.08■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ITGB8P26012 769 aa25.08■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 PDE4BQ07343 736 aa25.08■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.08■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 EVI5LQ96CN4 794 aa25.08■■□□□ 1.61
SOCS1-201ENST00000332029 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 TSPY3P0CV98 308 aa25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 TSPY8P0CW00 308 aa25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 ACLYP53396 1101 aa25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 PDE1AP54750 535 aa25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 PPARAQ07869 468 aa25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 AAMPQ13685 434 aa25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 UNC80Q8N2C7 3258 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA0355O15063 1070 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 OAZ1P54368 228 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO40Q9UH90 709 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 CUL9Q8IWT3 2517 aa25.06■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 RAG1P15918 1043 aa25.05■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 SLFN13Q68D06 897 aa25.05■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.05■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 CHST13Q8NET6 341 aa25.05■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.05■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 MOXD2PA6NHM9 499 aa25.04■■□□□ 1.6
SOCS1-201ENST00000332029 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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