RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 FIBPO43427 364 aa11.7□□□□□ -0.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.66□□□□□ -0.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 OATP04181 439 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.544e-8■■■□□ 15.6
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RABGGTB-201ENST00000319942 NOVP48745 357 aa11.66□□□□□ -0.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 FUT2Q10981 343 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 GRM4Q14833 912 aa11.66□□□□□ -0.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM151AQ8WW52 585 aa11.66□□□□□ -0.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.65□□□□□ -0.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 TNNI2P48788 182 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 MORN1Q5T089 497 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 CHD4Q14839 1912 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMA4Q16363 1823 aa11.65□□□□□ -0.54
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