RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2B2Q01814 1243 aa25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D12O60347 775 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2B1P20020 1258 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAPAP54920 295 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOMER1Q86YM7 354 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SDF4Q9BRK5 362 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.01■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FZD9O00144 591 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDF11O95390 407 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNA11P29992 359 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM200AQ8TCP9 573 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FERMT2Q96AC1 680 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VEZTQ9HBM0 779 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WNT7AO00755 349 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR8Q96EF0 704 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JMJD4Q9H9V9 463 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C6orf50Q9HD87 102 aa25■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GH2P01242 217 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASSF7Q02833 373 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC96Q2M329 555 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPF2Q92785 391 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.99■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JAG1P78504 1218 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GMCL1Q96IK5 515 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRELPP51888 382 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIN1Q05586 938 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLFN13Q68D06 897 aa24.98■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMCO2A6NFE2 343 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K10Q02779 954 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF174Q15697 407 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX1AQ16623 288 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ILDR2Q71H61 639 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.97■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC1A4P43007 532 aa24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTGDRQ13258 359 aa24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCTD1Q719H9 257 aa24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSRNP2Q9H175 543 aa24.96■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHTN1A0MZ66 631 aa24.95■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNI2P48788 182 aa24.95■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F5H6K3 240 aa24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB5O15062 677 aa24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLRC3Q07444 240 aa24.95■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNFAIP1Q13829 316 aa24.94■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANO10Q9NW15 660 aa24.94■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPON1Q9HCB6 807 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP17L10C9JJH3 530 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFB10O96000 172 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM7P33993 719 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC16A2P36021 539 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBX8Q9HC52 389 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.93■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADCY7P51828 1080 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INF2Q27J81 1249 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LONRF3Q496Y0 759 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPECC1Q5M775 1068 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MICALL2Q8IY33 904 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.92■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PRG0 241 aa24.91■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF165P49910 485 aa24.91■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COA7Q96BR5 231 aa24.91■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAD1O00515 517 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EGFRP00533 1210 aa24.9■■□□□ 1.58
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNNM3Q8NE01 707 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms