RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 KANSL2Q9H9L4 492 aa30.63■■■□□ 2.49
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HOXD8-201ENST00000313173 AP5Z1O43299 807 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXD8-201ENST00000313173 ATP2B2Q01814 1243 aa30.62■■■□□ 2.49
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HOXD8-201ENST00000313173 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
HOXD8-201ENST00000313173 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
HOXD8-201ENST00000313173 RASSF7Q02833 373 aa30.51■■■□□ 2.48
HOXD8-201ENST00000313173 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC1A4P43007 532 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXD8-201ENST00000313173 IL17AQ16552 155 aa30.51■■■□□ 2.47
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