RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304620.4

KRT78-201, Transcript of keratin 78, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT78, Length 1,778 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78-201ENST00000304620 ERVK-9P63128 1117 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ERVK-24P63145 666 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.01■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 CHST3Q7LGC8 479 aa23■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 DGKHQ86XP1 1220 aa23■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 NCOA7Q8NI08 942 aa23■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 BRD1O95696 1058 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 BMP3P12645 472 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 SLC1A4P43007 532 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 NECAB1Q8N987 351 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 GMCL1Q96IK5 515 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 TNKSO95271 1327 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 FCGRTP55899 365 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ARHGEF6Q15052 776 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 KCTD1Q719H9 257 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 PORCNQ9H237 461 aa22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ANKS1AQ92625 1134 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.98■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 TMEM232C9JQI7 657 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 FGD1P98174 961 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 BRF1Q92994 677 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.97■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 ANTXR2P58335 489 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 KIFC2Q96AC6 838 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 SRRDQ9UH36 339 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 FEM1BQ9UK73 627 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 MYPNQ86TC9 1320 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 MYH4Q9Y623 1939 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 VWA5AO00534 786 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 SEC23AQ15436 765 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 FBXL16Q8N461 479 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 GABRQQ9UN88 632 aa22.96■■□□□ 1.27
KRT78-201ENST00000304620 GNRH1P01148 92 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 PDHBP11177 359 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 PTMSP20962 102 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 GJB2P29033 226 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 PRKCZQ05513 592 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 PLS1Q14651 629 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 MB21D1Q8N884 522 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 DCAF4Q8WV16 495 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 GTF3C6Q969F1 213 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 KAT14Q9H8E8 782 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 SENP2Q9HC62 589 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.95■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 CCDC96Q2M329 555 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 PNMA1Q8ND90 353 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 REPS2Q8NFH8 660 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 RLFQ13129 1914 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 HOXD10P28358 340 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 MCM5P33992 734 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 STAT2P52630 851 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 STK3Q13188 491 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.94■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 BRCA2P51587 3418 aa22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 PRC1O43663 620 aa22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 CCNA1P78396 465 aa22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 COA7Q96BR5 231 aa22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 ABHD8Q96I13 439 aa22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 SNHG28P0DPA3 235 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 MAPK4P31152 587 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 SLC16A2P36021 539 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 FLT3LGP49771 235 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 APOBRQ0VD83 1088 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 GJD2Q9UKL4 321 aa22.92■■□□□ 1.26
KRT78-201ENST00000304620 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms