RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC12A2P55011 1212 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 GINS2Q9Y248 185 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 KDRP35968 1356 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC36A6NLP5 189 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CPXCR1Q8N123 301 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 FANCBQ8NB91 859 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNB1P01574 187 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa26.55■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 GAS7O60861 476 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP12O43422 761 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNA6P17658 529 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC8A1P32418 973 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 IRX4P78413 519 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SATB1Q01826 763 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 NSMCE1Q8WV22 266 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.54■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 APBA1Q02410 837 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 USH1CQ9Y6N9 552 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 OR52Z1P0C646 297 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP10Q12799 353 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 RABGGTAQ92696 567 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 USP44Q9H0E7 712 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL3Q9Y4R7 772 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 IWS1Q96ST2 819 aa26.53■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 NSMFQ6X4W1 530 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 COPB1P53618 953 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SCRN1Q12765 414 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS41P49754 854 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT81Q14533 505 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.52■■□□□ 1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L12C9JPN9 530 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L21D6R901 530 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GCKP35557 465 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 P4HA1P13674 534 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCY2DQ02846 1103 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SNCBQ16143 134 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC23Q9UJX2 597 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 MED23Q9ULK4 1368 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP14P31944 242 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.51■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD18B2RXH4 712 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 BAG2O95816 211 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CTSWP56202 376 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 HINFPQ9BQA5 517 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 STAM2O75886 525 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SCG2P13521 617 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE6CP51160 858 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CCT5P48643 541 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 NEK8Q86SG6 692 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 TNKSO95271 1327 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ATF2P15336 505 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQ27 194 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQ64 194 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQD8 194 aa26.5■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 OPHN1O60890 802 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR16Q569H4 304 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 GSDMBQ8TAX9 411 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNG1Q9UIX4 513 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.49■■□□□ 1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms