RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290417.6

GFRA4-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 1,427 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-201ENST00000290417 USP6NLQ92738 828 aa26.6■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 MROH8Q9H579 483 aa26.6■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 E7EWF7 191 aa26.59■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 SLC25A27O95847 323 aa26.59■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 INHAP05111 366 aa26.59■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 FAM160B2Q86V87 743 aa26.59■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 RIOX2Q8IUF8 465 aa26.59■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.59■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 POTEFA5A3E0 1075 aa26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 MAP2K5Q13163 448 aa26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 GRB14Q14449 540 aa26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 CPXCR1Q8N123 301 aa26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 TNKSO95271 1327 aa26.58■■□□□ 1.85
GFRA4-201ENST00000290417 STRNO43815 780 aa26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 APBA2Q99767 749 aa26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF236Q9UL36 1845 aa26.57■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 PLA2G6O60733 806 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 HMGCRP04035 888 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 PDHBP11177 359 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 CCL5P13501 91 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 SLC4A3P48751 1232 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 NCOA7Q8NI08 942 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 TRIB2Q92519 343 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 KAT14Q9H8E8 782 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 PNMA1Q8ND90 353 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 ANKS1AQ92625 1134 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.56■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 SLC27A2O14975 620 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 FDX1P10109 184 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 ADORA2AP29274 412 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 COPB2P35606 906 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 RGS19P49795 217 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 CCL14Q16627 93 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 DPP9Q86TI2 863 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 RNF208Q9H0X6 261 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.55■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 ATP2A1O14983 1001 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 FCER1AP12319 257 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 SLC16A2P36021 539 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 TRIM32Q13049 653 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 NECTIN1Q15223 517 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 RIPK3Q9Y572 518 aa26.54■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 BRCA2P51587 3418 aa26.53■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 SNAP25P60880 206 aa26.53■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.53■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 MMP19Q99542 508 aa26.53■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 SNHG28P0DPA3 235 aa26.52■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 OAZ1P54368 228 aa26.52■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF543Q08ER8 600 aa26.52■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 CHST3Q7LGC8 479 aa26.52■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 ABRAQ8N0Z2 381 aa26.52■■□□□ 1.84
GFRA4-201ENST00000290417 HOXC6P09630 235 aa26.51■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 SEC23AQ15436 765 aa26.51■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.51■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 CCDC174Q6PII3 467 aa26.51■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.51■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa26.51■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 COBLO75128 1261 aa26.5■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 KCTD2Q14681 263 aa26.5■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.5■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 ERICH2A1L162 156 aa26.49■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.49■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.49■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 SLC5A4Q9NY91 659 aa26.49■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 ZNF536O15090 1300 aa26.49■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 GJB1P08034 283 aa26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 RNF20Q5VTR2 975 aa26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 PGK2P07205 417 aa26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 ANTXR2P58335 489 aa26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 WTAPQ15007 396 aa26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 MFSD14CQ5VZR4 134 aa26.48■■□□□ 1.83
GFRA4-201ENST00000290417 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms