RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.29■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 BMP15O95972 392 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 DCAF4Q8WV16 495 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 CLIC6Q96NY7 704 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 GH2P01242 217 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 ATP2B1P20020 1258 aa25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 WNT7AO00755 349 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 TYRO3Q06418 890 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 TTC38Q5R3I4 469 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 RNF214Q8ND24 703 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF202O95125 648 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 NAPAP54920 295 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ESYT2A0FGR8 921 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 MAP3K10Q02779 954 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC96Q2M329 555 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 MTMR8Q96EF0 704 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 EGFRP00533 1210 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 SLFN13Q68D06 897 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 KCTD1Q719H9 257 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 TIGD1Q96MW7 591 aa25.25■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 MICALL2Q8IY33 904 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 C6orf50Q9HD87 102 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 F5H6K3 240 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 GNA11P29992 359 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 SLC1A4P43007 532 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 TNNI2P48788 182 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 GRIN1Q05586 938 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 KLRC3Q07444 240 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 GMCL1Q96IK5 515 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 SMCO2A6NFE2 343 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 SYKP43405 635 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 UVSSAQ2YD98 709 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.23■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF174Q15697 407 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 SDF4Q9BRK5 362 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 SLC16A2P36021 539 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 FERMT2Q96AC1 680 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 A0A1W2PRG0 241 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ZBTB5O15062 677 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 NDUFB10O96000 172 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 TNFAIP1Q13829 316 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 RASA3Q14644 834 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.21■■□□□ 1.63
CCDC7-201ENST00000277657 USP17L10C9JJH3 530 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 PTGDRQ13258 359 aa25.2■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 COA7Q96BR5 231 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 TEPSINQ96N21 525 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 CSRNP2Q9H175 543 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.19■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 CAP2P40123 477 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 SPECC1Q5M775 1068 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 TMX2Q9Y320 296 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 RAD21O60216 631 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 LMNB1P20700 586 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 MCM7P33993 719 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 UTRNP46939 3433 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 CAVIN2O95810 425 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 INF2Q27J81 1249 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.17■■□□□ 1.62
CCDC7-201ENST00000277657 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms