RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 KIFC2Q96AC6 838 aa24.68■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 GABRQQ9UN88 632 aa24.68■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 PRC1O43663 620 aa24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 PRKCZQ05513 592 aa24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 MTFR1Q15390 333 aa24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 PLS1Q14651 629 aa24.66■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.66■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 FAM160B2Q86V87 743 aa24.66■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.66■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 USP26Q9BXU7 913 aa24.66■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.66■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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COX5B-201ENST00000258424 MAPK4P31152 587 aa24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 MCM5P33992 734 aa24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 CCNA1P78396 465 aa24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 ZNF543Q08ER8 600 aa24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 WTAPQ15007 396 aa24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 NEK1Q96PY6 1258 aa24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 ERICH2A1L162 156 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 SLC16A2P36021 539 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 UBXN2AP68543 259 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 GPR142Q7Z601 462 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 COA7Q96BR5 231 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 LY9Q9HBG7 655 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.64■■□□□ 1.54
COX5B-201ENST00000258424 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 FLT3LGP49771 235 aa24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 KRT32Q14532 448 aa24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 GJD2Q9UKL4 321 aa24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.63■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ERCC3P19447 782 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SNAP25P60880 206 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 WDR78Q5VTH9 848 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 MTA3Q9BTC8 594 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CPVLQ9H3G5 476 aa24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ZBED4O75132 1171 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SEC24BO95487 1268 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CCL5P13501 91 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CPA1P15085 419 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 STAT3P40763 770 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CPXCR1Q8N123 301 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 TMEM87BQ96K49 555 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 RNF208Q9H0X6 261 aa24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ADCY3O60266 1144 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 GJB1P08034 283 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 C8orf34Q49A92 452 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 RIPK3Q9Y572 518 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ZNF536O15090 1300 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.6■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 MYH6P13533 1939 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 ATP2A1O14983 1001 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 GJA8P48165 433 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 IRF5Q13568 498 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 MORN1Q5T089 497 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 FDX1P10109 184 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 PTPREP23469 700 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 OAZ1P54368 228 aa24.58■■□□□ 1.53
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